Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A8Q9C0K1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A8Q9C0K1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms