Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCSER1Q9C0I3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER1Q9C0I3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
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