Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CIPCQ9C0C6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CIPCQ9C0C6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms