Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms