Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PARD6BQ9BYG5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARD6BQ9BYG5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms