Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRTQ9BXP5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRRTQ9BXP5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRRTQ9BXP5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
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