Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APOL6Q9BWW8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APOL6Q9BWW8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOL6Q9BWW8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOL6Q9BWW8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOL6Q9BWW8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOL6Q9BWW8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOL6Q9BWW8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOL6Q9BWW8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOL6Q9BWW8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOL6Q9BWW8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
APOL6Q9BWW8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOL6Q9BWW8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms