Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW7

SCRT1, Transcriptional repressor scratch 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT1Q9BWW7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCRT1Q9BWW7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCRT1Q9BWW7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms