Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HIRIP3Q9BW71 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
HIRIP3Q9BW71 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HIRIP3Q9BW71 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms