Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIOK2Q9BVS4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms