Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM109Q9BVC6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM109Q9BVC6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms