Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFHD1Q9BUP0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFHD1Q9BUP0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms