Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRDL1Q9BU40 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRDL1Q9BU40 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRDL1Q9BU40 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRDL1Q9BU40 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRDL1Q9BU40 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRDL1Q9BU40 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRDL1Q9BU40 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRDL1Q9BU40 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRDL1Q9BU40 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRDL1Q9BU40 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRDL1Q9BU40 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRDL1Q9BU40 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms