Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PI4K2AQ9BTU6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PI4K2AQ9BTU6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms