Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCM2Q9BSQ5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCM2Q9BSQ5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms