Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms