Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF8Q9BRL6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms