Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CITED1Q99966 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED1Q99966 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms