Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms