Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP2Q99959 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKP2Q99959 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PKP2Q99959 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PKP2Q99959 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP2Q99959 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PKP2Q99959 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP2Q99959 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP2Q99959 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP2Q99959 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP2Q99959 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP2Q99959 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP2Q99959 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP2Q99959 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP2Q99959 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP2Q99959 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP2Q99959 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP2Q99959 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP2Q99959 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP2Q99959 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP2Q99959 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP2Q99959 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP2Q99959 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP2Q99959 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP2Q99959 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP2Q99959 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP2Q99959 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP2Q99959 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP2Q99959 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP2Q99959 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP2Q99959 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP2Q99959 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP2Q99959 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PKP2Q99959 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP2Q99959 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP2Q99959 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP2Q99959 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP2Q99959 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP2Q99959 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP2Q99959 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP2Q99959 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP2Q99959 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP2Q99959 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP2Q99959 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP2Q99959 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP2Q99959 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP2Q99959 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP2Q99959 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP2Q99959 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP2Q99959 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP2Q99959 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP2Q99959 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PKP2Q99959 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP2Q99959 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKP2Q99959 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms