Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGPAT1Q99943 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGPAT1Q99943 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233 ms