Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3CQ99613 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3CQ99613 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3CQ99613 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3CQ99613 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF3CQ99613 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EIF3CQ99613 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EIF3CQ99613 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF3CQ99613 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3CQ99613 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms