Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC5LQ99459 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC5LQ99459 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC5LQ99459 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC5LQ99459 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC5LQ99459 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC5LQ99459 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC5LQ99459 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC5LQ99459 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC5LQ99459 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC5LQ99459 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC5LQ99459 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC5LQ99459 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC5LQ99459 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC5LQ99459 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC5LQ99459 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC5LQ99459 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC5LQ99459 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC5LQ99459 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC5LQ99459 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC5LQ99459 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms