Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT12Q99456 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms