Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHOX2BQ99453 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHOX2BQ99453 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms