Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTAGE1Q96RT6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CTAGE1Q96RT6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTAGE1Q96RT6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms