Protein–RNA interactions for Protein: Q96QA5

GSDMA, Gasdermin-A, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMAQ96QA5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMAQ96QA5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GSDMAQ96QA5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMAQ96QA5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms