Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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