Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA5Q96PV4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA5Q96PV4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA5Q96PV4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms