Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP3Q96P47 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGAP3Q96P47 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP3Q96P47 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms