Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIC6Q96NY7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLIC6Q96NY7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIC6Q96NY7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms