Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
LRRC7Q96NW7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC7Q96NW7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms