Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms