Protein–RNA interactions for Protein: Q96M02

C10orf90, Centrosomal protein C10orf90, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf90Q96M02 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf90Q96M02 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf90Q96M02 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms