Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00208Q96KT6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms