Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM8Q96KF7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM8Q96KF7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms