Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRAC1Q96KF2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRAC1Q96KF2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms