Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC136Q96JN2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC136Q96JN2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms