Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BORCS6Q96GS4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BORCS6Q96GS4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BORCS6Q96GS4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154 ms