Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRMT2BQ96GJ1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT2BQ96GJ1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms