Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP3Q96FM1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms