Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEURL3Q96EH8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEURL3Q96EH8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEURL3Q96EH8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms