Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C18orf8Q96DM3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C18orf8Q96DM3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms