Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL29Q96CT2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms