Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NSUN4Q96CB9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NSUN4Q96CB9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSUN4Q96CB9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms