Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJA10Q969M2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA10Q969M2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA10Q969M2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms