Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RFKQ969G6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms