Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCE1Q969G3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCE1Q969G3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCE1Q969G3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms