Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LHX4Q969G2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX4Q969G2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms