Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCAMP4Q969E2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAMP4Q969E2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAMP4Q969E2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms